荧光定量PCR实验报告 一、实验器材及试剂 1、 实验器材 名称 | 厂家 | 型号 | 离心机 | 安徽中科中佳 | 台式高速冷冻离心机KDC-140HR | 多样品研磨珠均质仪 | 上海净信 | Tissuelsyer-32 | 荧光定量PCR仪 | 上海宏石 | SLAN-96P | 超净工作台 | 力辰科技 | SW-CJ-2D | 标准试剂型纯水仪 | 青岛富勒姆科技有限公司 | FBZ2001-up-p | 离心管 | Axygen Biosciences |
| TIP头 | Axygen Biosciences |
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2、 主要实验试剂及耗材 试剂 | 厂家 | 货号 | Trizol Reagent | Invitrogen Life Technologies | 15596-026 | 三氯甲烷 | 国药集团化学试剂有限公司 | 10006818 | 异丙醇 | 国药集团化学试剂有限公司 | 80109218 | 无水乙醇 | 国药集团化学试剂有限公司 | 10009218 | HyPure TMMolecular Biology Grade Water | HyClone | SH30538.02 | RevertAid First Strand cDNA Synthesis Kit | Thermo | #K1622 | FastStart Universal SYBR Green Master(Rox) | Roche | 04 913 914 001 | 引物 | Invitrogen Biotechnology Co., LTD |
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75%乙醇:HyPure TMMolecular Biology Grade Water配制 离心管、TIP头均购湿热灭菌40min,干燥。
二、荧光定量PCR实验步骤 1、总RNA抽提(枪头和离心管均经过湿热灭菌,无RNA酶) 1)取匀浆器,加入1ml的Trizol Reagent,置冰上预冷。 2)取100mg组织,加入到匀浆器中。 3)充分研磨直至无可见组织块。 4)13000g离心10min取上清。 5)加入250 μl三氯甲烷,颠倒离心管15s,充分混匀,静置3min。 6)4℃下13000g离心8min。 7)将上清转移到一新的离心管中,加入0.8倍体积的异丙醇,颠倒混匀。 8)-20℃放置15min。 9)4℃下13000g离心10min,管底的白色沉淀即为RNA。 10)吸除液体,加入75%乙醇1.5ml洗涤沉淀。 11)4℃下13000g离心5min。 12)将液体吸除干净,将离心管置于超净台上吹3min。 13)加入20μl无RNA酶的水溶解RNA。 14)55℃孵育5min。 2、反转录(枪头和PCR均经过湿热灭菌,无RNA酶) 1)取一PCR管,加入含2μg RNA的溶液。 2)加入1μl oligo(dT)18。 3)用无核糖核酸酶的去离子水补足至12μl。 4)于PCR仪上70℃保温5min,迅速置冰上冷却。 5)依次加入4μl 5×buffer,2μl 10mM dNTPs,1μl RNA inhibitor和1μl 反转录酶,用枪抽吸混匀。 6)于PCR仪上42℃保温60min,结束后80℃保温5min灭活反转录酶。 3、定量PCR 1)取0.2ml PCR管,配制如下反应体系,每个反转录产物配制2管。 体系 | 20ul | 25ul | 50ul | 2XGreen qPCRMix | 10ul | 12ul | 25ul | 引物F | 0.5ul | 1ul | 2ul | 引物R | 0.5ul | 1ul | 2ul | cDNA模板 | 0.5ul | 1ul | 1ul | DdH2O | 8.5ul | 10ul | 20ul | 总体积 | 20ul | 25ul | 50ul |
例如扩25ul体系,每管中加入2XGreen qPCRMix 12ul, cDNA模板1ul, 引物F 1ul, 引物R 1ul , DdH2O 10ul. 短离心,可上机。 2)PCR反应程序设置 循环数 | 步骤 | 温度 | 时间 | 1 | 1(预变性) | 95℃ | 2min | 35-45 | 1(变性) | 95℃ | 15sec | 2(延伸) | 55℃--68℃ | 20-60sec | 1 | 1(降温) | 45℃ | 20sec | 1 | 1(溶解曲线) | 45℃--90℃ |
| 备注:延伸和溶解曲线要选荧光定量。 |
延伸和溶解曲线要选荧光定量。 PCR延伸温度可根据引物的Tm值,GC含量设定。 4、结果处理 ΔΔCT法: A=CT(目的基因,待测样本)- CT(内标基因,待测样本) B=CT(目的基因,对照样本)- CT(内标基因,对照样本) K=A-B 表达倍数=2-K
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